março – 2015

Sumário

  • Minha formação
  • Visão geral sobre padrões frequentes
  • Aplicações
  • Alguns trabalhos recentes

Minha formação

Instituições que fiz parte

Visão geral sobre padrões frequentes

Mineração de dados é uma maneira sistemática de organizar dados para facilitar a extração de informações úteis e desconhecidas

  • Mineração de regras de associação é uma das formas mais efetivas/populares
  • Introduzida para analisar padrões de consumo em supermercados
  • Ideia é identificar itens que são frequentemente comprados em uma única transação (padrões frequentes)

Aplicações

  • Marketing
  • Recuperação de informação
  • Bio/Quimio-informática
  • Sistemas de recomendação
  • Sistemas de classificação
Marketing
(a) Marketing

Aplicações – Sistemas de recomendação

Sistemas de recomendação

Aplicações – Quimioinformática (mineração de grafos)

Cafeína

Teobromina (Choc)

Teofilina (Asma)

Cafeína
Teobromina
Teofilina

Desafios

  • Minerar grandes volumes de dados
  • Adaptar/Desenhar algoritmos eficientes para problemas específicos
  • Auxiliar especialistas na aplicação desses algoritmos

Mineração de padrões discriminativos

Problema: encontrar padrões que sejam frequentes em um grupo, e que sejam infrequente nos demais.

  • Aplicações:
    • Caracterização de doenças (sadio x doente) (Yeoh et al., 2002)
    • E-learning (Romero et al., 2009)
    • Análise de tráfego em cidades (Lavrac et al., 2004)

Possibilidades a explorar

  • Uso de novas tecnologias para paralelização massiva (GPUs, Xeon-Phi, MapReduce …)
  • Uso de heurísticas (e.g. algoritmos genéticos)
  • Aplicações diversas

Alguns trabalhos recentes

Arefin AS, Vimieiro R, Riveros C, Craig H, Moscato P (2014) An Information Theoretic Clustering Approach for Unveiling Authorship Affinities in Shakespearean Era Plays and Poems. PLoS ONE 9(10): e111445. doi:10.1371/journal.pone.0111445

Agrupamento de obras literárias

Alguns trabalhos recentes

Milioli, H, Vimieiro, R, Riveros C, Tishchenko, I, Berretta, R, Moscato P (2015) The discovery of novel biomarkers improves breast cancer intrinsic subtype prediction and reconciles the labels in the METABRIC data set. PLoS ONE (em revisão)

Subtipos câncer de mama

Perguntas?

 

 

Obrigado!

Referências

Yeoh, E-J; et al. Classification, subtype discovery, and prediction of outcome in pediatric acute lymphoblastic leukemia by gene expression profiling, Cancer Cell, Volume 1, Issue 2, March 2002, Pages 133-143, ISSN 1535-6108, http://dx.doi.org/10.1016/S1535-6108(02)00032-6.

Romero, C.; González, P.; Ventura, S.; del Jesus, M.J.; Herrera, F. Evolutionary algorithms for subgroup discovery in e-learning: A practical application using Moodle data, Expert Systems with Applications, Volume 36, Issue 2, Part 1, March 2009, Pages 1632-1644, ISSN 0957-4174, http://dx.doi.org/10.1016/j.eswa.2007.11.026.

Lavrač, N., Kavšek, B., Flach, P. A., & Todorovski, L. (2004). Subgroup discovery with CN2-SD. Journal of Machine Learning Research, 5, 153 - 188.

Referências

Arefin AS, Vimieiro R, Riveros C, Craig H, Moscato P (2014) An Information Theoretic Clustering Approach for Unveiling Authorship Affinities in Shakespearean Era Plays and Poems. PLoS ONE 9(10): e111445. doi:10.1371/journal.pone.0111445

Vimieiro, R. and P. Moscato (2014). A new method for mining disjunctive emerging patterns in high-dimensional datasets using hypergraphs. Information Systems 40, 1-10.