| | Esta página contém maiores detalhes sobre o software
Consed.
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Objetivos
O principal objetivo do Consed é permitir a visualização do resultado
produzido pelo Phrap. Porém, ela vai bem mais longe e permite também que
os dados sejam editados.
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Edição
Como mencionado, o Consed permite a edição visual dos dados. Tais como, inserção,
remoção e alteração de (blocos de) bases.
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Integração
O nível de integração com o phrap é muito forte. Permitindo que o
Phrap, por exemplo, perceba as alterações realizadas em seu resultado
através do Consed e automaticamente tome as mesmas decisões em futuras
montagens realizadas no mesmo projeto.
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| Interface
A seguir é ilustrada a comunicação com o software Consed. Basicamente,
ele recebe como entrada arquivos no formato FASTA e algumas
informações sobre os contigs. Observe que os
dados de entrada são aqueles produzidos pelo Phrap. Após a leitura do
arquivo, o Consed mostra uma interface gráfica contendo os contigs e
algumas informações relacionadas a eles. A figura seguinte
ilustra essa troca de dados.
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